Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAV1Q03135 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms