Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POU3F1Q03052 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F1Q03052 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F1Q03052 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F1Q03052 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F1Q03052 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms