Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms