Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLOD1Q02809 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms