Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms