Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms