Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN7AQ01118 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN7AQ01118 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms