Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms