Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms