Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CDK6Q00534 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms