Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK3Q00526 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms