Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA4P83105 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms