Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP5P82980 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP5P82980 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP5P82980 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP5P82980 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP5P82980 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms