Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFI35P80217 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFI35P80217 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFI35P80217 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFI35P80217 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFI35P80217 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFI35P80217 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFI35P80217 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFI35P80217 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFI35P80217 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFI35P80217 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFI35P80217 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms