Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX3P78415 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX3P78415 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX3P78415 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX3P78415 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX3P78415 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX3P78415 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX3P78415 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX3P78415 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX3P78415 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX3P78415 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX3P78415 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX3P78415 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms