Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCS1P62166 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCS1P62166 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms