Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P61574 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P61574 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P61574 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P61574 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P61574 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P61574 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms