Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB10P61026 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB10P61026 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB10P61026 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB10P61026 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB10P61026 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB10P61026 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB10P61026 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB10P61026 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB10P61026 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB10P61026 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB10P61026 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms