Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms