Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BP1P59074 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms