Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCGRTP55899 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCGRTP55899 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms