Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFDNP55196 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFDNP55196 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFDNP55196 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFDNP55196 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AFDNP55196 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms