Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms