Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHBP55084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHBP55084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHBP55084 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHBP55084 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HADHBP55084 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HADHBP55084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HADHBP55084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms