Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAD23AP54725 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms