Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D1P54289 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D1P54289 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms