Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB3P54284 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms