Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMS2P54278 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P54278 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P54278 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P54278 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P54278 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms