Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRAP54198 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRAP54198 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRAP54198 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRAP54198 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRAP54198 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRAP54198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRAP54198 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRAP54198 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms