Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA1P52294 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA1P52294 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA1P52294 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA1P52294 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA1P52294 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms