Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP5P51878 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP5P51878 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP5P51878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP5P51878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP5P51878 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP5P51878 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP5P51878 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP5P51878 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP5P51878 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP5P51878 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP5P51878 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP5P51878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP5P51878 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP5P51878 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms