Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNA2P51530 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNA2P51530 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNA2P51530 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNA2P51530 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNA2P51530 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNA2P51530 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNA2P51530 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms