Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms