Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETV1P50549 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETV1P50549 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ETV1P50549 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ETV1P50549 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ETV1P50549 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ETV1P50549 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ETV1P50549 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ETV1P50549 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms