Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERFP50548 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERFP50548 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERFP50548 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERFP50548 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERFP50548 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERFP50548 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERFP50548 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms