Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATMP50440 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GATMP50440 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATMP50440 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATMP50440 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATMP50440 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATMP50440 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATMP50440 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATMP50440 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATMP50440 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATMP50440 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATMP50440 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATMP50440 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms