Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF6P49848 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF6P49848 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF6P49848 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF6P49848 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF6P49848 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF6P49848 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF6P49848 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms