Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPIAP49247 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPIAP49247 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPIAP49247 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPIAP49247 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPIAP49247 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPIAP49247 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPIAP49247 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPIAP49247 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPIAP49247 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPIAP49247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPIAP49247 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPIAP49247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPIAP49247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms