Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10P48553 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms