Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSSP48449 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSSP48449 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSSP48449 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSSP48449 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSSP48449 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSSP48449 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSSP48449 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms