Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms