Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UTRNP46939 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UTRNP46939 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UTRNP46939 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UTRNP46939 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UTRNP46939 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms