Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms