Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms