Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPOP42166 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPOP42166 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPOP42166 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMPOP42166 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMPOP42166 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPOP42166 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms