Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH1P40692 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH1P40692 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH1P40692 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH1P40692 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH1P40692 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH1P40692 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms