Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX1P40424 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX1P40424 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PBX1P40424 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms