Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7BP35670 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7BP35670 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7BP35670 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms