Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSP1P33241 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSP1P33241 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSP1P33241 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSP1P33241 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSP1P33241 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSP1P33241 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSP1P33241 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSP1P33241 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSP1P33241 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSP1P33241 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms