Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms